Ja! Dát was wat ik zocht! Om Samba niet (meer) te starten:
update-rc.d -f samba.sh remove
Om daarna Samba weer wél te starten:
update-rc.d samba.sh defaults
Om te zien of er links voor het starten en stoppen zijn aangemaakt:
ls -l /etc/rc[0-9].d/*samba.sh
(Als er S20samba.sh bestanden zijn, dan wordt Samba gestart (de K20... zijn de kill versies om samba te stoppen bij het afsluiten). Als deze 'ls -l' niets vindt, dan start Samba niet bij de start)